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這一年,百邁客云平臺(tái)的華麗麗麗麗大變身 ——做科研,我們是認(rèn)真的

彈指一揮間,2017年轉(zhuǎn)眼就到了要跟大家告別的時(shí)刻,在上一期的年終大盤點(diǎn)中跟大家分享了百邁客云平臺(tái)用戶的傲人成績,在累累碩果的背后,一直有著一群兢兢業(yè)業(yè)的生信人,這一年里,他們是根據(jù)廣大用戶的體驗(yàn)反饋,不斷改進(jìn),不斷更新,使咱們的云平臺(tái)來了一場華麗麗的大變身。細(xì)數(shù)這一年,云平臺(tái)總共更新53次,更新項(xiàng)目達(dá)200多個(gè),包括新主流程的上線,頁面版塊的調(diào)整,分析功能的完善,數(shù)據(jù)庫的改進(jìn),平臺(tái)速度的提升等。每一次改進(jìn)都是為了使云平臺(tái)的用戶有一個(gè)更好的分析體驗(yàn),每一次更新都希望用戶可以有更高效的科研產(chǎn)出。今天,咱們一起來瞅瞅百邁客云平臺(tái)17年到底有哪些大變樣。

 

2017全新上線篇

“讓基因分析更簡單”是百邁客云平臺(tái)前進(jìn)的不竭動(dòng)力,相信大家最關(guān)心的應(yīng)該是云平臺(tái)這一年有哪些新的分析流程上線。

2017

4/14??云平臺(tái)上線lncRNA v3.0主流程;

4/21??全基因組關(guān)聯(lián)(GWAS)分析平臺(tái)(Beta版,云服務(wù)個(gè)性化)正式上線;

6/9???BSA 分析平臺(tái) v1.0(Beta版,云服務(wù)個(gè)性化)正式上線;

9/22??全基因組重測序分析平臺(tái)3.0正式上線。做lncRNA,GWAS,BSA,全基因組重測序分析的用戶有福啦!

另外,早在2017年3月3日,咱們云平臺(tái)的云組第一期已正式上線,實(shí)現(xiàn)了組內(nèi)成員計(jì)算、存儲(chǔ)、工具的資源共享等功能,一個(gè)課題組的成員們可以同時(shí)享用同一個(gè)分析平臺(tái),再也不用為互傳數(shù)據(jù)和結(jié)果而煩憂;

2017年6月30日 ,移動(dòng)端微信公眾號全新改版,在百邁客云微信公眾號中添加文獻(xiàn)檢索、文獻(xiàn)解讀、文獻(xiàn)收藏、云賬號綁定、項(xiàng)目進(jìn)展查看和評價(jià)等功能,同期,在線支付功能上線,套餐用戶支持使用支付寶、微信在線購買分析平臺(tái)、小工具,收貨地址與個(gè)人信息關(guān)聯(lián),用戶可以在線填寫發(fā)票信息。

 

APP主流程更新篇

這么多新的APP成功上線了,顯然是一件值得慶賀的事情,無獨(dú)有偶,咱們已經(jīng)在線上的APP也從來沒有停止前進(jìn)的步伐。

2017

1/20??無參轉(zhuǎn)錄組分析APP進(jìn)行了全面更新還實(shí)現(xiàn)了圖片和基因之間的交互,新增“WGCNA”個(gè)性化工具,新增基因結(jié)構(gòu)挖掘功能等功能;

3/3??微生物多樣性分析APP更新至2.0版,新增6項(xiàng)分析內(nèi)容;并且美化了流程中各步驟生成的圖片,確保所有圖形結(jié)果有png圖和矢量圖等功能;

3/17??微生物多樣性分析APP再次更新:增加5個(gè)個(gè)性化分析內(nèi)容;同期,小RNA測序分析APP也進(jìn)行了20多項(xiàng)更新:增加小RNA所對應(yīng)的染色體、起始點(diǎn)、終止點(diǎn)信息和miRNA對應(yīng)的前體位置信息,支持更加精細(xì)化的檢索,添加一鍵繪圖等功能;

3/26??微生物多樣性分析APP更新了引導(dǎo)教程圖片;

6/16??微生物多樣性分析APP進(jìn)行了功能更新:基本分析和個(gè)性化中RDA/CCA環(huán)境因子支持文件上傳,增加保存歷史參數(shù)功能等;

7/7??ChIP-Seq 分析APP的基本分析,增加了Input/IP設(shè)置,且支持有生物學(xué)重復(fù)的差異分析等功能;

7/21??真核生物有參/無參分析APP個(gè)性化分析進(jìn)行了更新:基因挖掘中相應(yīng)添加eggNOG分類圖、KEGG分類圖、KEGG富集圖、GO富集圖、MA圖和火山圖等;

7/28??真核生物有參/無參分析APP個(gè)性化添加差異分組時(shí)增加Pvalue選項(xiàng);

8/25??lncRNA分析APP進(jìn)行了20多項(xiàng)的更新:新增圖片交互功能,增加火山圖、MA圖,增加矢量圖, Readme.pdf文件,WGCNA分析等;

9/1??微生物多樣性分析APP個(gè)性化更新,增加21個(gè)個(gè)性化且每個(gè)個(gè)性化都有多個(gè)參數(shù)可以調(diào)整分析;

12/1??微生物多樣性APP第四期更新:對OTU個(gè)數(shù)分布圖、物種分布柱狀圖、PCA分析等15項(xiàng)進(jìn)行了優(yōu)化。

 

極速體驗(yàn)更新篇

為了方便用戶能夠在短時(shí)間內(nèi)體驗(yàn)到云平臺(tái)的標(biāo)準(zhǔn)分析和個(gè)性化分析內(nèi)容,研發(fā)人員特意準(zhǔn)備了極速體驗(yàn)項(xiàng)目,標(biāo)準(zhǔn)分析在兩分鐘內(nèi)得到結(jié)題報(bào)告,隨后即可進(jìn)入個(gè)性化分析流程。

2017

3/31??有參、無參、表達(dá)譜,小RNA,四個(gè)分析平臺(tái)更新了極速體驗(yàn)項(xiàng)目,增加示例數(shù)據(jù);

6/30??群體三個(gè)分析平臺(tái)(BSA、全基因組關(guān)聯(lián)、基于第二代測序標(biāo)記的遺傳圖譜)增加極速體驗(yàn)功能。目前已有極速體驗(yàn)的分析平臺(tái)包括:真核生物有參轉(zhuǎn)錄組分析平臺(tái)、真核生物無參轉(zhuǎn)錄組分析平臺(tái)、小RNA測序分析平臺(tái)、LncRNA測序分析平臺(tái)、微生物多樣性分析平臺(tái)、數(shù)字基因表達(dá)譜分析平臺(tái)、醫(yī)學(xué)有參轉(zhuǎn)錄組分析平臺(tái)、外顯子組測序分析平臺(tái)。

是不是要為咱們的研發(fā)人員打個(gè)call?

云課堂更新篇

百邁客云課堂,絕對是您科研路上的好幫手。2017年百邁客云課堂先后共進(jìn)行了5次更新,現(xiàn)在的云課堂集185+線上培訓(xùn)課程于一體,囊括RNA系列、DNA系列、生物信息軟件使用和大家講壇等課程,針對分析平臺(tái)每款A(yù)PP都有詳細(xì)說明及步驟提示,無論有沒有生物信息學(xué)基礎(chǔ),都能幫助用戶在短期內(nèi)玩轉(zhuǎn)各類分析。

 

數(shù)據(jù)庫更新篇

整合利用公共數(shù)據(jù)發(fā)表論文是近年來的研究熱點(diǎn),2017年百邁客云平臺(tái)數(shù)據(jù)庫先后更新9次,包含8大數(shù)據(jù)庫、12PB公共數(shù)據(jù)、373萬樣本,共收錄826個(gè)參考基因組、2000+種醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)、306萬互作網(wǎng)絡(luò)關(guān)系、1700萬基因、8億變異數(shù)據(jù)。

 

小工具更新篇

2017年云平臺(tái)小工具先后更新了4次,包含PCA分析、WGCNA分析、轉(zhuǎn)錄因子預(yù)測、遺傳共線性分析、GO富集分析、聚類熱圖、柱狀圖、點(diǎn)線圖、miRNA基因家族分類等104款小工具和3大工具集,覆蓋12大功能類別:基因分析、遺傳進(jìn)化、ncRNA、質(zhì)控、組裝、比對、數(shù)據(jù)提取、突變、統(tǒng)計(jì)、表格處理、繪圖、序列分析等。

 

文獻(xiàn)功能更新篇

2017年云平臺(tái)對文獻(xiàn)模塊先后進(jìn)行了3次更新,如今查找文獻(xiàn)和數(shù)據(jù)導(dǎo)入都非常方便,共整合了2700+萬篇文獻(xiàn),同步NCBI數(shù)據(jù),設(shè)置多項(xiàng)過濾欄,方便快速查找,還可輕松獲得全文解讀,文章數(shù)據(jù)可一鍵導(dǎo)入分析。

 

云平臺(tái)其他功能更新篇

2017

3/10?云平臺(tái)建立項(xiàng)目進(jìn)展查詢機(jī)制,用戶通過云平臺(tái)可以及時(shí)了解項(xiàng)目進(jìn)度,增加項(xiàng)目線上評價(jià)功能,用戶可以在線對項(xiàng)目各個(gè)維度的服務(wù)進(jìn)行評價(jià),我們可以通過評價(jià)提升項(xiàng)目服務(wù)質(zhì)量,以及對頁面內(nèi)容進(jìn)行整理更新,使項(xiàng)目的管理更清晰;

4/10??云平臺(tái)結(jié)題報(bào)告進(jìn)行全面優(yōu)化,包括加載速度和流暢度,右側(cè)導(dǎo)航可以智能展開和收起,圖片可調(diào)大,添加專有名詞解釋;

5/19??Venn圖支持多個(gè)區(qū)域選擇,WGCNA添加分類模塊功能富集結(jié)果圖的展示,轉(zhuǎn)錄因子支持動(dòng)物物種的預(yù)測,有參支持按照指定基因名稱替換;

5/26??云科技官網(wǎng)上線文獻(xiàn)檢索、功能基因數(shù)據(jù)庫和學(xué)術(shù)課堂功能,不用登陸即可體驗(yàn)超強(qiáng)功能;

7/14??真核有參、小RNA測序、微生物多樣性、ChIP-Seq分析平臺(tái)增加pdf格式結(jié)題報(bào)告下載功能;

7/21??云平臺(tái)登錄支持第三方微信便捷登錄;

9/22??為了用戶在體驗(yàn)過程中的流暢度,在平臺(tái)登錄頁面添加了瀏覽器使用建議。貼心無處不在~

 

告別成績斐然的2017,迎來了充滿希望的2018,我們堅(jiān)信新的一年百邁客云平臺(tái)(BMKCloud)一定會(huì)再創(chuàng)輝煌,為廣大用戶提供一個(gè)更加完美的數(shù)據(jù)分析平臺(tái)。作為一個(gè)生物大數(shù)據(jù)分析的開放云平臺(tái),擁有龐大的專業(yè)用戶群和開發(fā)者用戶群(15000+),為用戶提供完整的生物信息分析以及整合利用公共數(shù)據(jù)的解決方案,我們一直在努力!



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